Koliko je precizno Sangerovo sekvenciranje?
Koliko je precizno Sangerovo sekvenciranje?

Video: Koliko je precizno Sangerovo sekvenciranje?

Video: Koliko je precizno Sangerovo sekvenciranje?
Video: Sanger sequencing 2024, Maj
Anonim

Sanger sekvenciranje sa 99,99% tačnost je „zlatni standard“za klinička istraživanja sekvenciranje . Međutim, novije NGS tehnologije također postaju uobičajene u kliničkim istraživačkim laboratorijama zbog svojih mogućnosti veće propusnosti i nižih troškova po uzorku.

Takođe je postavljeno pitanje zašto je NGS bolji od Sangera?

Sanger sekvenciranje može sekvencirati samo jedan po jedan fragment. Jer NGS koristi protočne ćelije koje mogu vezati milione dijelova DNK, NGS može čitati sve ove sekvence u isto vrijeme. Ova karakteristika visoke propusnosti čini je vrlo isplativom prilikom sekvenciranja velike količine DNK.

Osim toga, koja je svrha Sangerovog sekvenciranja? Sanger sekvenciranje je proces selektivne inkorporacije dideoksinukleotida koji završavaju lanac pomoću DNK polimeraze tokom in vitro replikacije DNK; to je najčešće korištena metoda za detekciju SNV-a.

Nakon toga, može se zapitati i koja je razlika između Sangerovog sekvenciranja i sekvenciranja sljedeće generacije?

sljedeći - sekvenciranje generacija (NGS) tehnologije su slične. Kritički razlika između Sangerovog sekvenciranja a NGS je sekvenciranje volumen. Dok je Sanger samo metoda sekvence jedan po jedan fragment DNK, NGS je masovno paralelan, sekvenciranje milioni fragmenata istovremeno po trčenju.

Kako funkcionira sekvenciranje završetka lanca?

Sanger DNK sekvenciranje je takođe poznat kao lanac - raskid metoda sekvenciranje . ddNTP-ovi rezultiraju raskid lanca DNK jer ddNTP-ovima nedostaje 3'-OH grupa potrebna za formiranje fosfodiestarske veze između nukleotida. Bez ove veze, lanac nukleotida koji se formiraju je prekinut.

Preporučuje se: